La polychromie la plus remarquable ici procède de la sculpture architecturale, présente aussi bien sur les consoles de support des nervures des voûtes que sur les emblèmes héraldiques des nervures. De plus, un des murs comporte encore des peintures, très abîmées, qui faisaient sans doute partie d’une scène plus vaste. D’après la documentation, cette scène était présidée par une Vierge flanquée de deux anges, avec à ses pieds la représentation du fondateur de la chapelle, Arnau Sescomes.