Suivant la dynamique des siècles précédents, la colline fut de nouveau le théâtre de conflits. Une fois les travaux de fortification complétés, les interventions pendant le conflit (1936-1939) furent minimes. Mentionnons toutefois l’installation de batteries antiaériennes sur les bastions du Roi et de la Reine ou encore la transformation de certains espaces de la colline en zones d’exécution.

Des petits travaux furent également réalisés, par exemple la construction du refuge anti-bombardement situé sous le Château du Roi ou celle du bunker construit du côté du bastion de Louvigny, tous deux encore visibles. Finalement, la cathédrale fut convertie en camp de concentration en avril de l’année 1938.